Taksonomie (biologie)
In die biologie is taksonomie (van die antieke Griekse τάξις ( taxi's ) 'rangskikking' en -νομία ( -nomia ) ' metode ') die wetenskaplike studie van benaming, definiëring ( omskrywing ) en klassifikasie van groepe biologiese organismes gebaseer op gedeelde eienskappe. Organismes word in taksa gegroepeer (enkelvoud: takson) en hierdie groepe kry 'n taksonomiese rang ; groepe van 'n gegewe rang kan saamgevoeg word om 'n meer inklusiewe groep van hoër rang te vorm en sodoende 'n taksonomiese hiërargie te skep. Die belangrikste geledere in moderne gebruik is domein , koninkryk , filum (verdeling word soms in die plantkunde in die plek van filum gebruik), klas , orde , familie , geslag en spesies . Die Sweedse plantkundige Carl Linnaeus word beskou as die grondlegger van die huidige stelsel van taksonomie, aangesien hy 'n rangstelsel ontwikkel het, bekend as Linnaeense taksonomie vir die kategorisering van organismes en binominale nomenklatuur vir die benaming van organismes.
Met die vordering in die teorie, data en analitiese tegnologie van biologiese sistematiek, het die Linnaeuse stelsel verander in 'n stelsel van moderne biologiese klassifikasie wat bedoel is om die evolusieverhoudings tussen lewende en uitgestorwe organismes te weerspieël .
Definisie
Die presiese definisie van taksonomie wissel van bron tot bron, maar die kern van die vakgebied bly: die konsepsie, benaming en klassifikasie van groepe organismes. [1] As verwysingspunte word die volgende definisies van taksonomie hieronder aangebied:
- Teorie en praktyk om individue in spesies te groepeer, spesies in groter groepe te rangskik en name aan hulle te gee en sodoende 'n klassifikasie te gee. [2]
- 'N Wetenskapsveld (en hoofkomponent van sistematiek ) wat beskrywing, identifikasie, nomenklatuur en klassifikasie omvat [3]
- Die wetenskap van klassifikasie, in biologie die ordening van organismes in 'n klassifikasie [4]
- "Die wetenskap van klassifikasie soos toegepas op lewende organismes, insluitend die studie van die vorming van spesies, ens." [5]
- "Die analise van eienskappe van 'n organisme vir klassifikasie" [6]
- " Systematika bestudeer filogenie om 'n patroon te gee wat vertaal kan word in die klassifikasie en name van die meer inklusiewe veld van taksonomie" (gelys as 'n wenslike, maar ongewone definisie) [7]
Die uiteenlopende definisies plaas taksonomie as 'n sub-area van sistematiek (definisie 2), omkeer die verband (definisie 6), of dit lyk asof die twee terme sinoniem is. Daar is meningsverskil oor die vraag of biologiese nomenklatuur as 'n deel van taksonomie beskou word (definisies 1 en 2), of as 'n deel van sistematiek buite taksonomie. [8] Definisie 6 is byvoorbeeld gekoppel aan die volgende definisie van sistematiek wat die benaming buite taksonomie plaas: [6]
- Sistematiek : "Die studie van die identifisering, taksonomie en nomenklatuur van organismes, insluitend die klassifikasie van lewende dinge met betrekking tot hul natuurlike verwantskappe en die studie van variasie en die evolusie van taksa".
'N Hele stel terme, waaronder taksonomie, sistematiese biologie , sistematiek, biosistematiek , wetenskaplike klassifikasie, biologiese klassifikasie en filogenetika, het soms oorvleuelende betekenisse gehad - soms dieselfde, soms effens anders, maar altyd verwant en kruisend. [1] [9] Die breedste betekenis van 'taksonomie' word hier gebruik. Die term self is in 1813 deur de Candolle in sy Théorie élémentaire de la botanique bekendgestel . [10]
Monografie en taksonomiese hersiening
'N Taksonomiese hersiening of taksonomiese oorsig is 'n nuwe analise van die variasiepatrone in 'n bepaalde takson . Hierdie analise kan uitgevoer word op grond van enige kombinasie van verskillende soorte karakters, soos morfologiese, anatomiese, palinologiese, biochemiese en genetiese. 'N Monografie of volledige hersiening is 'n omvattende hersiening vir 'n takson vir die inligting wat op 'n bepaalde tydstip gegee word, en vir die hele wêreld. Ander (gedeeltelike) hersienings kan beperk word in die sin dat dit slegs van die beskikbare karakterstelle mag gebruik of 'n beperkte ruimtelike omvang het. 'N Hersiening lei tot 'n aanpassing van of nuwe insigte in die verhoudings tussen die subtaksa binne die takson wat bestudeer word, wat kan lei tot 'n verandering in die klassifikasie van hierdie subtaxa, die identifisering van nuwe subtaksie of die samesmelting van vorige subtaksa. [11]
Alfa- en beta-taksonomie
Die term ' alfa-taksonomie ' word vandag hoofsaaklik gebruik om te verwys na die dissipline om taksa , veral spesies , te vind, te beskryf en te benoem . [12] In vroeëre literatuur het die term 'n ander betekenis gehad, met verwysing na morfologiese taksonomie en die produkte van navorsing tot aan die einde van die 19de eeu. [13]
William Bertram Turrill het die term "alfa-taksonomie" bekendgestel in 'n reeks artikels wat in 1935 en 1937 gepubliseer is, waarin hy die filosofie en moontlike toekomstige rigtings van die dissipline van taksonomie bespreek. [14]
... daar is 'n toenemende begeerte onder taksonomiste om hul probleme vanuit wyer oogpunte te oorweeg, om die moontlikhede van nouer samewerking met hul sitologiese, ekologiese en genetiese kollegas te ondersoek en te erken dat 'n hersiening of uitbreiding, miskien van 'n drastiese aard, van hul doelstellings en metodes, kan wenslik wees ... Turrill (1935) het voorgestel dat, alhoewel die ouer waardevolle taksonomie, gebaseer op struktuur, en die gemaklik aangewese "alfa" aanvaar word, dit wel moontlik is om 'n verafgeleë taksonomie te sien waarop gebou is as 'n wye basis van morfologiese en fisiologiese feite as moontlik, en een waarin 'plek gevind word vir alle waarnemings- en eksperimentele gegewens wat verband hou, selfs al is dit indirek, met die samestelling, onderverdeling, oorsprong en gedrag van spesies en ander taksonomiese groepe'. Ideale kan, kan gesê word, nooit heeltemal verwesenlik word nie. Dit het egter 'n groot waarde om as permanente stimulante op te tree, en as ons 'n mate van, selfs vae, ideaal het van 'n 'omega'-taksonomie, kan ons 'n entjie verder in die Griekse alfabet vorder. Sommige van ons behaag onsself deur te dink dat ons nou in 'n "beta" -taksonomie tas. [14]
Turrill sluit dus eksplisiet verskillende studierigtings wat hy binne taksonomie in sy geheel insluit in, soos ekologie, fisiologie, genetika en sitologie uit die alfa-taksonomie. Hy sluit filogenetiese rekonstruksie verder uit van alfa-taksonomie (bl. 365–366).
Latere outeurs het die term in 'n ander sin gebruik, om die afbakening van spesies (nie subspesies of taksa van ander geledere nie) te beteken, met behulp van die ondersoektegnieke wat beskikbaar is, en met inbegrip van gesofistikeerde rekenaar- of laboratoriumtegnieke. [15] [12] Dus, Ernst Mayr in 1968 gedefinieer " beta taksonomie " as die klassifikasie van geledere hoër as spesie. [16]
'N Begrip van die biologiese betekenis van variasie en van die evolusionêre oorsprong van groepe verwante spesies is nog belangriker vir die tweede fase van taksonomiese aktiwiteit, die sortering van spesies in groepe familie ("taxa") en die rangskikking daarvan in 'n hiërargie van hoër kategorieë. Die aktiwiteit is wat die term klassifikasie aandui; dit word ook 'beta-taksonomie' genoem.
Mikrotaksonomie en makrotaksonomie
Hoe spesies in 'n bepaalde groep organismes moet gedefinieer word gee aanleiding tot praktiese en teoretiese probleme wat na verwys word as die spesie probleem . Die wetenskaplike werk om te besluit hoe spesies gedefinieer moet word, word mikrotaksonomie genoem. [17] [18] [12] Makrotaksonomie is bygevoeg die studie van groepe in die hoër taksonomiese geledere van die subgenus en hoër. [12]
Geskiedenis
Alhoewel sommige beskrywings van die taksonomiese geskiedenis probeer om taksonomie uit antieke beskawings te dateer, het 'n ware wetenskaplike poging om organismes te klassifiseer eers in die 18de eeu plaasgevind. Vroeëre werke was hoofsaaklik beskrywend en het gefokus op plante wat nuttig was vir landbou of medisyne. Daar is 'n aantal fases in hierdie wetenskaplike denke. Vroeë taksonomie was gebaseer op arbitrêre kriteria, die sogenaamde "kunsmatige stelsels", insluitend Linnaeus se stelsel van seksuele klassifikasie vir plante (Natuurlik het Linnaeus se klassifikasie van diere die titel gehad "Systema Naturae" ("die Stelsel van die Natuur"), wat daarop dui dat hy het ten minste geglo dat dit meer as 'n 'kunsmatige stelsel' was. Later kom stelsels wat gebaseer is op 'n meer volledige oorweging van die kenmerke van taksa, wat 'natuurlike stelsels' genoem word, soos dié van de Jussieu (1789), de Candolle (1813) en Bentham en Hooker (1862–1863). Hierdie klassifikasies het empiriese patrone beskryf en was pre- evolusionêr in die denke. Die publikasie van Charles Darwin 's On the Origin of Species (1859) het gelei tot 'n nuwe verklaring vir klassifikasies, gebaseer op evolusionêre verhoudings. Dit was die konsep van filetiese stelsels vanaf 1883. Hierdie benadering is gekenmerk deur dié van Eichler (1883) en Engler (1886–1892). Die koms van cladistiese metodologie in die 1970's het gelei tot klassifikasies gebaseer op die enigste maatstaf van monofiel , ondersteun deur die aanwesigheid van sinapomorfies . Sedertdien is die bewysgrondslag uitgebrei met data van molekulêre genetika wat meestal die tradisionele morfologie aanvul . [19] [ bladsy benodig ] [20] [ bladsy benodig ] [21] [ bladsy benodig ]
Voor-Linnaean
Vroeë taksonomiste
Ons noem en klassifiseer ons omgewing waarskynlik al so lank as wat die mensdom kon kommunikeer. Dit sou altyd belangrik gewees het om die name van giftige en eetbare plante en diere te ken om hierdie inligting aan ander lede van die gesin of groep oor te dra. Medisyne-illustrasies verskyn in Egiptiese muurskilderye van c. 1500 vC, wat aandui dat die gebruik van verskillende soorte verstaan word en dat 'n basiese taksonomie in plek is. [22]
Antieke tye

Organismes is die eerste keer deur Aristoteles ( Griekeland , 384–322 vC) geklassifiseer tydens sy verblyf op die eiland Lesbos . [23] [24] [25] Hy het wesens geklassifiseer volgens hul dele, of in moderne terme eienskappe , soos lewende geboorte, vier bene, eiers lê, bloed hê of warm wees. [26] Hy het alle lewende dinge in twee groepe verdeel: plante en diere. [24] Sommige van sy groepe diere, soos Anhaima (diere sonder bloed, vertaal as ongewerwelde diere ) en Enhaima (diere met bloed, ongeveer die gewerwelde diere ), sowel as groepe soos die haaie en walvisdiere , word vandag nog algemeen gebruik. [27] Sy student Theophrastus (Griekeland, 370–285 v.C.) het hierdie tradisie voortgesit en ongeveer 500 plante en die gebruik daarvan in sy Historia Plantarum genoem . Weereens kan verskeie plantgroepe wat tans nog herken word, teruggevoer word na Theophrastus, soos Cornus , Crocus en Narcissus . [24]
Middeleeuse
Taksonomie in die Middeleeue was grotendeels gebaseer op die Aristoteliese stelsel , [26] met toevoegings rakende die filosofiese en eksistensiële orde van wesens. Dit het begrippe soos die Groot ketting van wees in die Westerse skolastiese tradisie, [26] ingesluit , wat uiteindelik weer uit Aristoteles gekom het. Die aristoteliese stelsel het nie plante of swamme geklassifiseer nie, weens die destydse gebrek aan mikroskope, [25] aangesien sy idees daarop gebaseer was om die volledige wêreld in een enkele kontinuum te rangskik, volgens die scala naturae (die Natuurlike Ladder). [24] Dit is ook in ag geneem in die Groot ketting van die wese. [24] Vooruitgang is gemaak deur geleerdes soos Procopius , Timotheos van Gaza , Demetrios Pepagomenos en Thomas Aquinas . Middeleeuse denkers gebruik abstrakte filosofiese en logiese kategoriserings wat meer geskik is vir abstrakte filosofie as vir pragmatiese taksonomie. [24]
Renaissance en vroegmoderne
Gedurende die Renaissance en die Tydperk van Verligting het kategoriserende organismes meer voorgekom, [24] en taksonomiese werke het ambisieus genoeg geword om die ou tekste te vervang. Dit word soms toegeskryf aan die ontwikkeling van gesofistikeerde optiese lense, wat die morfologie van organismes in baie groter besonderhede kon bestudeer. Een van die vroegste skrywers wat van hierdie tegnologiese sprong gebruik gemaak het, was die Italiaanse geneesheer Andrea Cesalpino (1519–1603), wat 'die eerste taksonoom' genoem is. [28] Sy magnum opus De Plantis verskyn in 1583 en beskryf meer as 1500 plantspesies. [29] [30] Twee groot plantfamilies wat hy die eerste keer herken het, word vandag nog gebruik: die Asteraceae en Brassicaceae . [31] In die 17de eeu het John Ray ( Engeland , 1627–1705) baie belangrike taksonomiese werke geskryf. [25] Waarskynlik was sy grootste prestasie Methodus Plantarum Nova (1682), [32] waarin hy besonderhede van meer as 18.000 plantspesies gepubliseer het. Destyds was sy klassifikasies miskien die ingewikkeldste wat nog deur enige taksonoom opgelewer is, aangesien hy sy taksa op baie gekombineerde karakters gebaseer het. Die volgende groot taksonomiese werke is vervaardig deur Joseph Pitton de Tournefort (Frankryk, 1656–1708). [33] Sy werk vanaf 1700, Institutiones Rei Herbariae , het meer as 9000 spesies in 698 genera ingesluit, wat Linné direk beïnvloed het, want dit was die teks wat hy as jong student gebruik het. [22]
Die Linné-era

Die Sweedse plantkundige Carl Linnaeus (1707–1778) [26] het 'n nuwe era van taksonomie ingelui. Met sy belangrikste werke Systema Naturae 1st Edition in 1735, [34] Species Plantarum in 1753, [35] en Systema Naturae 10th Edition , [36] het hy 'n rewolusie in die moderne taksonomie gemaak. Sy werke geïmplementeer 'n gestandaardiseerde binomiale nomenklatuur stelsel vir diere- en plantspesies, [37] wat blyk te wees 'n elegante oplossing vir 'n chaotiese en ongeorganiseerd taksonomiese literatuur. Hy het nie net die standaard van klas, orde, geslag en spesies ingestel nie, maar ook dit moontlik gemaak om plante en diere uit sy boek te identifiseer deur die kleiner dele van die blom te gebruik. [37] Die Linnaeense stelsel is dus gebore en word vandag nog op dieselfde manier gebruik as in die 18de eeu. [37] Tans beskou plant- en dieretaksonome Linnaeus se werk as die 'beginpunt' vir geldige name (onderskeidelik 1753 en 1758). [38] Name wat voor hierdie datums gepubliseer is, word 'pre-Linnaean' genoem, en nie as geldig beskou nie (met die uitsondering van spinnekoppe wat in Svenska Spindlar [39] gepubliseer word ). Selfs taksonomiese name wat voor hierdie datums deur Linné self gepubliseer is, word as pre-Linneaans beskou. [22]
Moderne klassifikasiestelsel


'N Patroon van groepe geneste binne groepe is wat deur klassifikasies van plante en diere Linnaeus, en hierdie patrone begin om verteenwoordig te word as dendrograms van die dier en plant koninkryke teen die einde van die 18de eeu, lank voor On the Origin of Species gepubliseer . [25] Die patroon van die 'Natuurlike Stelsel' het nie 'n ontwikkelingsproses, soos evolusie, meegebring nie, maar dit het moontlik geïmpliseer en vroeë transmutasionistiese denkers geïnspireer. Onder die vroeë werke wat die idee van 'n transmutasie van spesies ondersoek het, was Erasmus Darwin 's 1796 Zoönomia en Jean-Baptiste Lamarck ' s Philosophie Zoologique van 1809. [12] Die idee is in die Engelse wêreld gewild gemaak deur die spekulatiewe, maar baie geleesde Vestiges van die Natural History of Creation , anoniem gepubliseer deur Robert Chambers in 1844. [40]
Met Darwin se teorie het vinnig 'n algemene aanvaarding geblyk dat 'n klassifikasie die Darwinistiese beginsel van gemeenskaplike afkoms moet weerspieël . [41] Voorstellings van lewensboom het gewild geword in wetenskaplike werke, met bekende fossielgroepe opgeneem. Een van die eerste moderne groepe wat aan fossielvoorouers gekoppel was, was voëls . [42] Met behulp van die destyds pas ontdekte fossiele van Archaeopteryx en Hesperornis , het Thomas Henry Huxley uitgespreek dat hulle ontwikkel het uit dinosourusse, 'n groep wat in 1842 deur Richard Owen formeel benoem is . [43] [44] Die gevolglike beskrywing, die van dinosourusse "wat gee tot die "voorouers van" voëls "of", is die wesenlike kenmerk van evolusionêre taksonomiese denke. Aangesien al meer fossielgroepe in die laat 19de en vroeë 20ste eeu gevind en herken is, het paleontoloë gewerk om die geskiedenis van diere deur die eeue te verstaan deur bekende groepe aan mekaar te koppel. [45] Met die moderne evolusiesintese van die vroeë veertigerjare was daar 'n wesenlike moderne begrip van die evolusie van die hoofgroepe. Aangesien evolusionêre taksonomie gebaseer is op Linnaeense taksonomiese geledere, is die twee terme grootliks uitruilbaar in moderne gebruik. [46]
Die cladistiese metode het sedert die 1960's ontstaan. [41] In 1958 het Julian Huxley die term clade gebruik. [12] Later, in 1960, het Cain en Harrison die term cladistic bekendgestel. [12] Die opvallende kenmerk is om taxa in 'n hiërargiese evolusionêre boom te rangskik , met die desideratum dat alle genoemde taxa monofileties is. [41] ' n Takson word monofileties genoem as dit al die afstammelinge van 'n voorvaderlike vorm bevat. [47] [48] Groepe wat afstammelinge van hulle verwyder, word parafileties genoem , [47] terwyl groepe wat meer as een tak van die boom van die lewe verteenwoordig, polifileties genoem word . [47] [48] Monofiletiese groepe word herken en gediagnoseer aan die hand van sinapomorfieë , gedeelde afgeleide karaktertoestande. [49]
Kladistiese klassifikasies is verenigbaar met die tradisionele Linneaanse taksonomie en die Codes of Zoological and Botanical Nomenclature. [50] ' n Alternatiewe stelsel van nomenklatuur, die Internasionale Kode vir Filogenetiese Nomenklatuur of PhyloCode , is voorgestel, met die doel om die formele benaming van klades te reguleer . [51] [52] Linnaean-geledere sal opsioneel wees onder die PhyloCode , wat bedoel is om saam te bestaan met die huidige, ranggebaseerde kodes. [52] Dit moet nog gesien word of die sistematiese gemeenskap die PhyloCode sal aanneem of verwerp ten gunste van die huidige stelsels van nomenklatuur wat al meer as 250 jaar gebruik word (en aangepas word).
Koninkryke en domeine

Goed voor Linné is plante en diere as afsonderlike koninkryke beskou. [53] Linné gebruik dit as die hoogste rang, wat die fisiese wêreld in die groente-, dier- en minerale koninkryke verdeel. Namate die vooruitgang in mikroskopie klassifikasie van mikro-organismes moontlik gemaak het, het die aantal koninkryke toegeneem, en vyf- en ses-koninkryksisteme is die algemeenste.
Domeine is 'n relatief nuwe groepering. Die eerste keer in 1977 voorgestel, word Carl Woese se drie-domeinstelsel eers later aanvaar. [54] Een hoofkenmerk van die drie-domein-metode is die skeiding van Archaea en Bacteria , voorheen gegroepeer in die enkele koninkryk Bacteria ('n koninkryk ook soms Monera genoem ), [53] met die Eukaryota vir alle organismes waarvan die selle ' n kern bevat . [55] ' n Klein aantal wetenskaplikes sluit 'n sesde koninkryk, Archaea, in, maar aanvaar nie die domeinmetode nie. [53]
Thomas Cavalier-Smith , wat baie gepubliseer het oor die klassifikasie van protiste , het onlangs [ wanneer? ] stel voor dat die Neomura , die klade wat die Archaea en Eucarya saamvoeg , sou ontwikkel het uit Bakterieë, meer presies uit Actinobacteria . Sy klassifikasie in 2004 behandel die argeobakterieë as deel van 'n subgebied van die koninkryk Bakterieë, dws hy verwerp die drie-domeinstelsel heeltemal. [56] Stefan Luketa het in 2012 'n vyf "dominion" -stelsel voorgestel wat Prionobiota (asellulêr en sonder nukleïensuur) en Virusobiota ( acellulêr maar met nukleïensuur) by die tradisionele drie domeine gevoeg het. [57]
Linné 1735 [58] | Haeckel 1866 [59] | Chatton 1925 [60] | Copeland 1938 [61] | Whittaker 1969 [62] | Woese et al. 1990 [63] | Cavalier-Smith 1998 [56] | Cavalier-Smith 2015 [64] |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2 koninkryke | 3 koninkryke | 2 ryke | 4 koninkryke | 5 koninkryke | 3 domeine | 2 ryke, 6 koninkryke | 2 ryke, 7 koninkryke |
(nie behandel nie) | Protista | Prokaryota | Monera | Monera | Bakterieë | Bakterieë | Bakterieë |
Archaea | Archaea | ||||||
Eukaryota | Protoctista | Protista | Eucarya | Protosoë | Protosoë | ||
Chromista | Chromista | ||||||
Vegetabilia | Plantae | Plantae | Plantae | Plantae | Plantae | ||
Swamme | Swamme | Swamme | |||||
Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia | Animalia |
Onlangse omvattende klassifikasies
Gedeeltelike klassifikasies bestaan vir baie individuele groepe organismes en word hersien en vervang namate nuwe inligting beskikbaar word; omvattende, gepubliseerde behandelings van die meeste of die hele lewe is egter skaarser; onlangse voorbeelde is dié van Adl et al., 2012 en 2019, [65] [66] wat slegs eukariote dek, met die klem op protiste, en Ruggiero et al., 2015, [67] wat sowel eukariote as prokariote dek tot die rang van Orde, alhoewel albei fossielverteenwoordigers uitsluit. [67] ' n Afsonderlike samestelling (Ruggiero, 2014) [68] dek bestaande taksa tot die rang van familie. Ander databasisgedrewe behandelings sluit in die Encyclopedia of Life , die Global Biodiversity Information Facility , die NCBI-taksonomiedatabasis , die tussentydse register van mariene en nie-mariene geslagte , die Open Tree of Life en die Catalogue of Life . Die Paleobiologie-databasis is 'n bron vir fossiele.
Toepassing
Biologiese taksonomie is 'n subdissipline van biologie , en word gewoonlik beoefen deur bioloë wat bekend staan as 'taksonome', hoewel entoesiastiese natuurkundiges ook gereeld betrokke is by die publikasie van nuwe taksa. [69] Omdat taksonomie doelwitte te beskryf en te organiseer lewe , die werk wat deur taksonome is noodsaaklik vir die studie van biodiversiteit en die gevolglike veld van bewaringsbiologie . [70] [71]
Klassifiseer organismes
Biologiese klassifikasie is 'n kritieke onderdeel van die taksonomiese proses. As gevolg hiervan lig dit die gebruiker in oor die verwagtinge dat die familielede van die taxon is. Biologiese klassifikasie gebruik taksonomiese ranglyste, insluitend onder andere (in volgorde van die mees inklusiewe tot die minste inklusiewe): Domein , Koninkryk , Filum , Klas , Orde , Familie , Geslag , Soort en Stam . [72] [noot 1]
Taksonomiese beskrywings

Die "definisie" van 'n takson word saamgevat deur die beskrywing of diagnose daarvan, of deur albei saam. Daar is geen vaste reëls wat die definisie van taxa reguleer nie, maar die benaming en publikasie van nuwe taxa word deur reëls bepaal. [8] In dierkunde word die nomenklatuur vir die meer gebruikte range ( superfamilie tot subspesies ) gereguleer deur die International Code of Zoological Nomenclature ( ICZN Code ). [73] Op die gebied van fikologie , mikologie en plantkunde word die benaming van taksa gereguleer deur die Internasionale Kode vir Nomenklatuur vir alge, swamme en plante ( ICN ). [74]
Die aanvanklike beskrywing van 'n takson behels vyf hoofvereistes: [75]
- Die takson moet 'n naam kry wat gebaseer is op die 26 letters van die Latynse alfabet ('n binomiaal vir nuwe spesies, of uninomiaal vir ander geledere).
- Die naam moet uniek wees (dit wil sê nie 'n homoniem nie ).
- Die beskrywing moet gebaseer wees op ten minste een naam-draende tipe monster.
- Dit moet stellings bevat oor toepaslike eienskappe om die takson te beskryf (definieer) of om dit van ander taksas te onderskei (die diagnose, ICZN-kode , artikel 13.1.1, ICN , artikel 38). Albei kodes skei doelbewus die inhoud van 'n taxon (die omskrywing daarvan ) van die definisie van die naam.
- Hierdie eerste vier vereistes moet gepubliseer word in 'n werk wat in talle identiese eksemplare verkrygbaar is, as 'n permanente wetenskaplike rekord.
Daar is egter baie meer inligting ingesluit, soos die geografiese omvang van die takson, ekologiese aantekeninge, chemie, gedrag, ens. Hoe navorsers hul taksa bereik, wissel: afhangende van die beskikbare data en bronne, wissel die metodes van eenvoudige kwantitatiewe of kwalitatiewe. vergelykings van opvallende kenmerke, om rekenaaranalises van groot hoeveelhede DNA-volgorde- data uit te brei . [76]
Skrywer aanhaling
'N "Owerheid" kan na 'n wetenskaplike naam geplaas word. [77] Die owerheid is die naam van die wetenskaplike of wetenskaplikes wat die naam eers geldig gepubliseer het. [77] In 1758 het Linnaeus byvoorbeeld aan die Asiatiese olifant die wetenskaplike naam Elephas maximus gegee , sodat die naam soms geskryf word as " Elephas maximus Linnaeus, 1758". [78] Die name van outeurs word gereeld afgekort: die afkorting L., vir Linné, word algemeen gebruik. In die plantkunde is daar in werklikheid 'n gereguleerde lys standaardafkortings (sien die lys van plantkundiges volgens die outeursafkorting ). [79] Die stelsel vir die toekenning van owerhede verskil effens tussen plantkunde en dierkunde . [8] Dit is egter standaard dat indien die soort van 'n spesie verander is sedert die oorspronklike beskrywing, die naam van die oorspronklike gesag tussen hakies geplaas word. [80]
Fenetika
In fenetika, ook bekend as taksimetrie, of numeriese taksonomie, word organismes geklassifiseer op grond van algehele ooreenkoms, ongeag hul filogenie of evolusionêre verwantskappe. [12] Dit het 'n mate van evolusionêre 'afstand' tussen taksa tot gevolg. Fenetiese metodes het in die moderne tyd relatief skaars geword, hoofsaaklik vervang deur kladistiese ontledings, aangesien fenetiese metodes nie algemene voorvaderlike (of plesiomorfe ) eienskappe van nuwe algemene (of apomorfe) eienskappe onderskei nie. [81] Sekere fenetiese metodes, soos die buurverbinding , het egter hul weg gevind in die cladistiek, as 'n redelike benadering van filogenie wanneer meer gevorderde metodes (soos Bayes-afleiding ) te berekenend duur is. [82]
Databasisse
Moderne taksonomie gebruik databasistegnologieë om klassifikasies en die dokumentasie daarvan te soek en te katalogiseer. [83] Alhoewel daar geen algemeen gebruikte databasis is nie, is daar omvattende databasisse soos die Catalogue of Life , wat poog om elke gedokumenteerde spesie te lys. [84] Die katalogus het vanaf April 2016 1,64 miljoen spesies vir alle koninkryke gelys, met aanspraak op dekking van meer as driekwart van die geskatte spesies wat die moderne wetenskap ken. [85]
Sien ook
- Outomatiese identifikasie van spesies
- Bakteriële taksonomie
- Kladogram
- Kladistiek
- Cluster-analise
- Konsortium vir die strepieskode van die lewe
- Konsortium van Europese taksonomiese fasiliteite
- Dendrogram
- Genetipes
- Woordelys van wetenskaplike benaming
- Identifikasie (biologie)
- Incertae sedis
- Oop boom van die lewe
- Parataksonomie
- Fenogram
- Versamelingsteorie
- Taksonomie (algemeen)
- Virusklassifikasie
Aantekeninge
- ^ Hierdie rangstelsel kan onthou word deur die mnemonic "Do Kings Play Chess On Fine Glass Sets?"
Verwysings
- ^ a b Wilkins, JS (5 Februarie 2011). "Wat is sistematiek en wat is taksonomie?" . Op 27 Augustus 2016 vanaf die oorspronklike argief . Besoek op 21 Augustus 2016 .
- ^ Judd, WS; Campbell, CS; Kellogg, EA; Stevens, PF; Donoghue, MJ (2007). "Taksonomie". Plantstelsels: 'n filogenetiese benadering (3de uitg.). Sunderland: Sinauer Associates.
- ^ Simpson, Michael G. (2010). "Hoofstuk 1 Plantstelsels: 'n oorsig". Plant Systematics (2de uitg.). Akademiese pers. ISBN 978-0-12-374380-0.
- ^ Kirk, PM, Cannon, PF, Minter, DW, Stalpers, JA eds. (2008) "Taksonomie". In Dictionary of the Fungi , 10de uitgawe. CABI, Nederland.
- ^ Walker, PMB, red. (1988). Die Wordsworth-woordeboek vir wetenskap en tegnologie . WR Chambers Ltd. en Cambridge University Press.
- ^ a b Lawrence, E. (2005). Henderson's Dictionary Of Biology . Pearson / Prentice Hall. ISBN 978-0-13-127384-9.
- ^ Wheeler, Quentin D. (2004). "Taksonomiese triage en die armoede van filogenie". In HCJ Godfray & S. Knapp (red.). Taksonomie vir die een-en-twintigste eeu . Filosofiese transaksies van die Royal Society . 359 . bl. 571–583. doi : 10.1098 / rstb.2003.1452 . PMC 1693342 . PMID 15253345 .
- ^ a b c "Benaming, name en taksonomie" . Interberg Herbarium - USU . 2005. Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 23 November 2016.
- ^ Small, Ernest (1989). "Sistematiek van biologiese sistematiek (Of, taksonomie van taksonomie)". Taxon . 38 (3): 335–356. doi : 10.2307 / 1222265 . JSTOR 1222265 .
- ^ Singh, Gurcharan (2004). Plantstelsels: 'n geïntegreerde benadering . Wetenskap-uitgewers. bl. 20. ISBN 978-1-57808-351-0 - via Google Boeke.
- ^ Maxted, Nigel (1992). "Om 'n taksonomiese hersieningsmetodologie te definieer". Taxon . 41 (4): 653–660. doi : 10.2307 / 1222391 . JSTOR 1222391 .
- ^ a b c d e f g h "Taksonomie: betekenis, vlakke, tydperke en rol" . Biologiebespreking . 27 Mei 2016. Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 5 April 2017.[ onbetroubare bron? ]
- ^ Rosselló-Mora, Ramon; Amann, Rudolf (1 Januarie 2001). "Die spesiekonsep vir prokariote" . FEMS Mikrobiologie Resensies . 25 (1): 39–67. doi : 10.1111 / j.1574-6976.2001.tb00571.x . ISSN 1574-6976 . PMID 11152940 .
- ^ a b Turrill, WB (1938). "Die uitbreiding van taksonomie met spesiale verwysing na Spermatophyta". Biologiese resensies . 13 (4): 342–373. doi : 10.1111 / j.1469-185X.1938.tb00522.x . S2CID 84905335 .
- ^ Steyskal, GC (1965). "Trendkurwes van die tempo van spesiebeskrywing in dierkunde". Wetenskap . 149 (3686): 880–882. Bibcode : 1965Sci ... 149..880S . doi : 10.1126 / science.149.3686.880 . PMID 17737388 . S2CID 36277653 .
- ^ Mayr, Ernst (9 Februarie 1968), "The Role of Systematics in Biology: The study of all aspects of the diversity of life is one of the most important concern in biology", Science , 159 (3815): 595–599, Bibcode : 1968Sci ... 159..595M , doi : 10.1126 / science.159.3815.595 , PMID 4886900
- ^ Mayr, Ernst (1982). "Hoofstuk 6: Mikrotaksonomie, die wetenskap van spesies" . Die groei van biologiese denke: diversiteit, evolusie en erfenis . Belknap Press van Harvard University Press. ISBN 978-0-674-36446-2.
- ^ Msgstr "Resultaat van u navraag" . www.biologiese-konsepte.com . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Datta 1988 .
- ^ Stace 1989 .
- ^ Stuessy 2009 .
- ^ a b c Manktelow, M. (2010) Geskiedenis van taksonomie Argief 29 Mei 2015 by die Wayback Machine . Lesing van Dept. Sistematiese Biologie, Uppsala Universiteit .
- ^ Mayr, E. (1982) Die groei van biologiese denke . Belknap P. van Harvard UP, Cambridge (Mass.)
- ^ a b c d e f g "Paleos: taksonomie" . palaeos.com . Op 31 Maart 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ a b c d "taksonomie | biologie" . Ensiklopedie Britannica . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ a b c d "Biologie 101, Hfst 20" . www.cbs.dtu.dk . 23 Maart 1998. Gearchiveer uit die oorspronklike op 28 Junie 2017.
- ^ Leroi, Armand Marie (2014). Die strandmeer: hoe Aristoteles die wetenskap uitgevind het . Bloomsbury. bl. 384–395. ISBN 978-1-4088-3622-4.
- ^ "Andrea Cesalpino | Italiaanse geneesheer, filosoof en plantkundige" . Ensiklopedie Britannica . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Cesalpino, Andrea; Marescotti, Giorgio (1583). De plantis libri XVI . Florence: Apud Georgium Marescottum - via internetargief.
- ^ "Andrea Cesalpino | Italiaanse geneesheer, filosoof en plantkundige" . Ensiklopedie Britannica . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Jaime, Prohens (2010). Internasionale uitgawe Groente I: Asteraceae, Brassicaceae, Chenopodicaceae en Cucurbitaceae (Handboek vir planteteling) . ISBN 978-1-4419-2474-2.
- ^ John, Ray (1682). "Methodus plantarum nova" . impensis Henrici Faithorne & Joannis Kersey, ad insigne Rofæ Coemeterio D. Pauli. Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 29 September 2017. Aanhaaljoernaal benodig
|journal=
( hulp ) - ^ "Joseph Pitton de Tournefort | Franse plantkundige en geneesheer" . Ensiklopedie Britannica . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Linnaeus, C. (1735) Systema naturae, sive regna tria naturae systematice proposita per klasse, ordines, genera en spesies . Haak, Leiden
- ^ Linnaeus, C. (1753) Soort Plantarum . Stockholm, Swede.
- ^ Linnaeus, C. (1758) Systema naturae, sive regna tria naturae systematice proposita per klasse, ordines, genera, en spesies , 10de uitgawe. Haak, Leiden
- ^ a b c "taksonomie - Die Linnaese stelsel | biologie" . Ensiklopedie Britannica . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Donk, MA (Desember 1957). "Tipering en latere beginpunte" (PDF) . Taxon . 6 (9): 245–256. doi : 10.2307 / 1217493 . JSTOR 1217493 . Gearchiveer (PDF) vanaf die oorspronklike op 18 Mei 2015.
- ^ Carl, Clerck; Carl, Bergquist; Eric, Borg; L., Gottman; Lars, Salvius (1757). "Svenska spindlar" . Literis Laur. Salvii. Op 1 Desember 2017 vanaf die oorspronklike argief . Aanhaaljoernaal benodig
|journal=
( hulp ) - ^ Secord, James A. (2000). Victoriaanse sensasie: die buitengewone publikasie, ontvangs en geheime outeurskap van oorblyfsels van die natuurlike geskiedenis van die skepping . Universiteit van Chicago Press . ISBN 978-0-226-74410-0. Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 16 Mei 2008.
- ^ a b c "taksonomie - Klassifikasie sedert Linné | biologie" . Ensiklopedie Britannica . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ "Fossiel van die vroegste moderne voël ter wêreld kan ons help om die uitwissing van dinosourusse te begryp ." Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .[ beter bron benodig ]
- ^ Huxley, TH (1876): Lesings oor evolusie. New York Tribune . Ekstra. geen. 36. In Versamelde opstelle IV: pp. 46–138 oorspronklike teks met figure Gearchiveer op 28 Junie 2011 by die Wayback Machine
- ^ "Thomas Henry Huxley | Britse bioloog" . Ensiklopedie Britannica . Op 6 Februarie 2018 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Rudwick, MJS (1985). Die betekenis van fossiele: episodes in die geskiedenis van paleontologie . Universiteit van Chicago Press. bl. 24. ISBN 978-0-226-73103-2.
- ^ Paterlini, Marta (September 2007). "Daar sal orde wees. Die nalatenskap van Linné in die era van molekulêre biologie" . EMBO-verslae . 8 (9): 814–816. doi : 10.1038 / sj.embor.7401061 . PMC 1973966 . PMID 17767191 .
- ^ a b c Taylor, Mike. "Wat beteken terme soos monofileties, parafileties en polifileties?" . www.miketaylor.org.uk . Op 1 Augustus 2010 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ a b "Polifileties teenoor monofileties" . ncse.com . Op 5 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Brower, Andrew VZ en Randall T. Schuh. 2021. Biologiese sistematiek: beginsels en toepassings (3de uitg.) Cornell University Press, Ithaca, NY.
- ^ Schuh, Randall T. "Die Linnaean-stelsel en sy volharding van 250 jaar." The Botanical Review 69, nr. 1 (2003): 59.
- ^ Queiroz, Philip D. Cantino, Kevin de. "Die PhyloCode" . www.ohio.edu . Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 10 Mei 2016.
- ^ a b "PhyloCode: konsep, geskiedenis en voordele | taksonomie" . Biologiebespreking . 12 Julie 2016. Argief van die oorspronklike op 5 April 2017.[ onbetroubare bron? ]
- ^ a b c "Koninkryksindeling van lewende organisme" . Biologiebespreking . 2 Desember 2014. Argief van die oorspronklike op 5 April 2017.[ onbetroubare bron? ]
- ^ "Carl Woese | Carl R. Woese Instituut vir Genomiese Biologie" . www.igb.Illinois.edu . Op 28 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Cracraft, Joel en Donaghue, Michael J. (reds.) (2004). Die samestelling van die boom van die lewe . Oxford, Engeland: Oxford University Press. ISBN 0-19-517234-5 . bl. 45, 78, 555
- ^ a b Cavalier-Smith, T. (1998). "'N Hersiene lewensstelsel met ses koninkryke" . Biologiese resensies . 73 (03): 203–66. doi : 10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x . PMID 9809012 .
- ^ Luketa, S. (2012). "Nuwe sienings oor die megaklassifikasie van die lewe" (PDF) . Protistologie . 7 (4): 218–237. Gearchiveer (PDF) vanaf die oorspronklike op 2 April 2015.
- ^ Linnaeus, C. (1735). Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per klasse, ordines, genera & spesies .
- ^ Haeckel, E. (1866). Generelle Morphologie der Organismen . Reimer, Berlyn.
- ^ Chatton, É. (1925). " Pansporella perplexa . Reflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires". Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale . 10-VII: 1–84.
- ^ Copeland, H. (1938). "Die koninkryke van organismes". Kwartaallikse oorsig van die biologie . 13 : 383–420. doi : 10.1086 / 394568 .
- ^ Whittaker, RH (Januarie 1969). "Nuwe konsepte van koninkryke van organismes". Wetenskap . 163 (3863): 150–60. Bibcode : 1969Sci ... 163..150W . doi : 10.1126 / science.163.3863.150 . PMID 5762760 .
- ^ Woese, C .; Kandler, O .; Wheelis, M. (1990). "Op pad na 'n natuurlike stelsel van organismes: voorstel vir die domeine Archaea, Bacteria en Eucarya" . Verrigtinge van die National Academy of Sciences van die Verenigde State van Amerika . 87 (12): 4576–9. Bibcode : 1990PNAS ... 87.4576W . doi : 10.1073 / pnas.87.12.4576 . PMC 54159 . PMID 2112744 .
- ^ Ruggiero, Michael A .; Gordon, Dennis P .; Orrell, Thomas M .; Borgtog, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C .; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D .; Kirk, Paul M .; Thuesen, Erik V. (2015). "'N Hoër vlak klassifikasie van alle lewende organismes" . PLOS EEN . 10 (4): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . doi : 10.1371 / joernaal.pone.0119248 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .
- ^ Adl, SM; Simpson, AGB; Lane, CE; Lukeš, J .; Bass, D .; Bowser, SS; et al. (Desember 2015). "Die hersiene klassifikasie van eukariote" . Tydskrif vir eukariotiese mikrobiologie . 59 (5): 429–493. doi : 10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x . PMC 3483872 . PMID 23020233 .
- ^ Adl, SM; Bass, D .; Lane, CE; Lukeš, J .; Schoch, CL; Smirnov, A .; et al. (2019). "Hersienings van die indeling, benaming en diversiteit van eukariote" . Tydskrif vir eukariotiese mikrobiologie . 66 (1): 4–119. doi : 10.1111 / jeu.12691 . PMC 6492006 . PMID 30257078 .
- ^ a b Ruggiero, MA; Gordon, DP; Orrell, TM; Bailly, N .; Bourgoin, T .; Brusca, RC; et al. (2015). "'N Hoër vlak klassifikasie van alle lewende organismes" . PLOS EEN . 10 (4): e0119248. Bibcode : 2015PLoSO..1019248R . doi : 10.1371 / joernaal.pone.0119248 . PMC 4418965 . PMID 25923521 .
- ^ Ruggiero, Michael A. (2014). Gesinne van alle lewende organismes, weergawe 2.0.a.15, (4/26/14). Expert Solutions International, LLC, Reston, VA. 420 pp. Ingesluit data beskikbaar vir aflaai via https://www.gbif.org/dataset/8067e0a2-a26d-4831-8a1e-21b9118a299c (doi: 10.15468 / tfp6yv)
- ^ "'N Paar slegte wetenskaplikes dreig om taksonomie te stuit" . Smithsonian . Besoek op 24 Februarie 2019 .
- ^ "Wat is taksonomie?" . Londen: Natuurhistoriese museum. Gegearchiveer vanaf die oorspronklike op 1 Oktober 2013 . Besoek op 23 Desember 2017 .
- ^ McNeely, Jeffrey A. (2002). "Die rol van taksonomie in die bewaring van biodiversiteit" (PDF) . J. Nat. Bewaar . 10 (3): 145–153. doi : 10.1078 / 1617-1381-00015 . S2CID 16953722 . Gearchiveer vanaf die oorspronklike (PDF) op 24 Desember 2017 - via Semantic Scholar.
- ^ "Mnemoniese taksonomie / biologie: Kingdom Phylum Class Order ..." Gearchiveer uit die oorspronklike op 6 Junie 2017.
- ^ "ICZN-kode" . www.animalbase.uni-goettingen.de .
- ^ "Internasionale kode vir naamgewing vir alge, swamme en plante" . Internasionale Vereniging vir Planttaksonomie . Op 11 Januarie 2013 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ "Hoe kan ek nuwe spesies beskryf?" . Internasionale Kommissie vir Dierkundige Nomenklatuur . Op 6 Maart 2012 vanaf die oorspronklike argief . Besoek op 21 Mei 2020 .
- ^ "Taksonomie - Evaluering van taksonomiese karakters" . Encyclopædia Britannica . Op 22 April 2019 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ a b "Wysigingswenk: wetenskaplike name van spesies | AJE | American Journal Experts" . www.aje.com . Op 9 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ "Carolus Linnaeus: Klassifikasie, taksonomie en bydraes tot die biologie - Transkripsie vir video en les | Study.com" . Study.com . Op 9 April 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ Biocyclopedia.com. "Biologiese klassifikasie" . www.biocyclopedia.com . Op 14 Mei 2017 vanaf die oorspronklike argief .
- ^ "Dierkundige naamgewing: 'n basiese gids vir outeurs wat nie taksonomies is nie" . Annelida.net . Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 16 Maart 2017.
- ^ "Klassifikasie" . Noord-Carolina Staatsuniversiteit . Op 14 April 2017 vanaf die oorspronklike argief . Besoek op 27 April 2017 .
- ^ McDonald, David (herfs 2008). "Molekulêre merkerwoordelys" . Universiteit van Wyoming . Gearchiveer vanaf die oorspronklike op 10 Junie 2007.
- ^ Wood, Dylan; King, Margaret; Landis, Drew; Courtney, William; Wang, Runtang; Kelly, Ross; Turner, Jessica A .; Calhoun, Vince D. (26 Augustus 2014). "Gebruik moderne webtoepassingstegnologie om intuïtiewe en doeltreffende instrumente vir data-visualisering en -deling te skep" . Grense in neuro-informatika . 8 : 71. doi : 10.3389 / fninf.2014.00071 . ISSN 1662-5196 . PMC 4144441 . PMID 25206330 .
- ^ "About - The Plant List" . www.theplantlist.org .
- ^ "Oor die lewensboek: 2016 Jaarlikse kontrolelys" . Katalogus van die lewe . Geïntegreerde taksonomiese inligtingstelsel (ITIS). Op 15 Mei 2016 vanaf die oorspronklike argief . Besoek op 22 Mei 2016 .
Bibliografie
- Stace, Clive A. (1989) [1980]. Planttaksonomie en biosistematiek (2de uitg.). Cambridge: Cambridge University Press . ISBN 978-0-521-42785-2. Besoek op 19 April 2015 .
- Datta, Subhash Chandra (1988). Sistematiese plantkunde (4 uitg.). Nieu-Delhi: New Age International. ISBN 978-81-224-0013-7. Besoek op 25 Januarie 2015 .
- Stuessy, Tod F. (2009). Planttaksonomie: die stelselmatige evaluering van vergelykende data . Columbia University Press. ISBN 978-0-231-14712-5. Besoek op 6 Februarie 2014 .
Eksterne skakels
- Wat is taksonomie? by die Natural History Museum in Londen
- Taksonomie by NCBI, die Nasionale Sentrum vir Biotegnologie-inligting
- Taksonomie by UniProt the Universal Protein Resource
- ITIS is die geïntegreerde taksonomiese inligtingstelsel
- CETaF die konsortium van Europese taksonomiese fasiliteite
- Wikispecies gratis spesiesgids
- Biologiese klassifikasie.